Portrait Prof. Dr. Waldmann

Herbert Waldmann

Direktor, Chemische Biologie


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> Auf der Suche nach (un)erwünschten Nebenwirkungen

> Herbert Waldmann für bahnbrechenden Beitrag zur Chemischen Biologie ausgezeichnet

Für seine herausragenden Leistungen auf dem Gebiet der Chemie hat Herbert Waldmann die Liebig-Denkmünze der Gesellschaft Deutscher Chemiker (GDCh) erhalten. Hier sehen Sie das Preisträger-Interview.

Interview mit Prof. Herbert Waldmann, Preisträger der Liebig-Denkmünze

Für seine herausragenden Leistungen auf dem Gebiet der Chemie hat Herbert Waldmann die Liebig-Denkmünze der Gesellschaft Deutscher Chemiker (GDCh) erhalten. Hier sehen Sie das Preisträger-Interview.
https://www.youtube.com/watch?v=EL36Dt7purY

Forschung im Überblick

Chemische Biologie >

Wir forschen an der Schnittstelle von organischer Chemie und Biologie. Basierend auf der bio- und cheminformatischen Kartierung des biologisch relevanten chemischen Strukturraumes entwickeln wir neue Strategien für die Synthese von Naturstoff (NP)-inspirierten Substanzbibliotheken, um sie für die Untersuchung biologischer Phänomene zu verwenden. Naturstoffe und ihre strukturellen Grundgerüste stellen die biologisch vorvalidierten Regionen des chemischen Strukturraums dar, der durch die Natur selbst vorgegeben wurde. In unserem Biologie Orientierten Synthese (BIOS)-Programm haben wir verschiedene NP-inspirierte Substanzbibliotheken synthetisiert. Diese Verbindungen werden im zellbasierten Screening eingesetzt, um Modulatoren verschiedener zellulärer Prozesse zu identifizieren. Wir setzen verschiedene biochemische und biologische Methoden ein, um die Zielproteine der aktiven Verbindungen zu finden. Besondere Aufmerksamkeit widmen wir der Identifizierung von kleinen Molekülen zur Modulation der Funktion und Aktivität von GTPasen der Ras-Familie.


Am MPI Dortmund entwickelte Naturstoff-inspirierte (und andere) Substanzen

Ausgewählte Publikationen

PubMed Liste>

Akbarzadeh M, Flegel J, Patil S, Shang E, Narayan R, Buchholzer M, Jasemi NSK, Grigalunas M, Krzyzanowski A, Abegg D, Shuster A, Potowski M, Karatas H, Karageorgis G, Mosaddeghzadeh N, Zischinsky ML, Merten C, Golz C, Brieger L, Strohmann C, Antonchick AP, Janning P, Adibekian A, Goody RS, Ahmadian MR, Ziegler S, Waldmann H (2022). The Pseudo-Natural Product Rhonin Targets RHOGDI. Angew Chem Int Ed Engl.
Quelle

Schneidewind T, Brause A, Schölermann B, Sievers S, Pahl A, Sankar MG, Winzker M, Janning P, Kumar K, Ziegler S, Waldmann H (2021). Combined morphological and proteome profiling reveals target-independent impairment of cholesterol homeostasis. Cell Chem Biol.
Quelle

Grigalunas M, Burhop A, Zinken S, Pahl A, Gally JM, Wild N, Mantel Y, Sievers S, Foley DJ, Scheel R, Strohmann C, Antonchick AP, Waldmann H (2021). Natural product fragment combination to performance-diverse pseudo-natural products. Nat Commun.
Quelle

Liu J, Cremosnik GS, Otte F, Pahl A, Sievers S, Strohmann C, Waldmann H (2021). Design, synthesis and biological evaluation of chemically and biologically diverse pyrroquinoline pseudo natural products Angew Chem Int Ed Engl.
Quelle

Guéret SM, Thavam S, Carbajo RJ, Potowski M, Larsson N, Dahl G, Grossmann T, Plowright AT, Valeur E, Lemruell M and Waldmann H (2020). Macrocyclic Modalities Combining Peptide Epitopes and Natural Product Fragments. J Am Chem Soc.  
Quelle

Foley DJ, ZInken S, Corkery D, Laraia L, Pahl A, Wu Y, Waldmann H (2020). Phenotyping reveals the targets of a pseudo-natural product autophagy inhibitor. Angew Chem Int Ed Engl.  
doi: 10.1002/anie.202000364

Adihou H, Gopalakrishnan R, Förster T, Guéret SM, Gasper R, Geschwindner S, Carrillo García C, Karatas H, Pobbati AV, Vazquez-Chantada M, Davey P, Wassvik CM, Pang JKS, Soh BS, Hong W, Chiarparin E, Schade D, Plowright AT, Valeur E, Lemurell M, Grossmann TN, Waldmann H. (2020). A protein tertiary structure mimetic modulator of the Hippo signalling pathway. Nat Commun
doi: 10.1038/s41467-020-19224-8.

Laraia L, Garivet G, Foley DJ, Kaiser N, Müller S, Zinken S, Pinkert T, Wilke J, Corkery D, Pahl A, Sievers S, Janning P, Arenz C, Wu Y, Rodriguez R, Waldmann H (2019). Image-based Morphological Profiling Identifies a Lysosomotropic, Iron-Sequestering Autophagy Inhibitor. Angew Chem Int Ed Engl
doi: 10.1002/anie.201913712.

Kremer L, Hennes E, Brause A, Ursu A, Robke L, Matsubayashi HT, Nihongaki Y, Flegel J, Mejdrová I, Eickhoff J, Baumann M, Nencka R, Janning P, Kordes S, Schöler HR, Sterneckert J, Inoue T, Ziegler S, Waldmann H (2019). Discovery of the Hedgehog Pathway Inhibitor Pipinib that Targets PI4KIIIß. Angew Chem Int Ed Engl
doi: 10.1002/anie.201907632.

Laraia L, Friese A, Corkery Dp, Konstantinidis G, Erwin N, Hofer W, Karatas H, Klewer L, Brockmeyer A, Metz M, Schölermann B, Dwivedi M, Li L, Rios-Munoz P, Köhn M, Winter R, Vetter IR, Ziegler S, Janning P, Wu YW and Waldmann H (2019). The cholesterol transfer protein GRAMD1A regulates autophagosome biogenesis Nat Chem Biol
doi.org/10.1038/s41589-019-0307-5

Karageorgis G, Reckzeh ES, Ceballos J, Schwalfenberg M, Sievers S, Ostermann C, Pahl A, Ziegler S, Waldmann H (2018). Chromopynones are pseudo natural product glucose uptake inhibitors targeting glucose transporters GLUT-1 and -3. Nat Chem
doi: 10.1038/s41557-018-0132-6.

Brand S, Roy S, Schröder P, Rathmer B, Roos J, Kapoor S, Patil S, Pommerenke C, Maier T, Janning P, Eberth S, Steinhilber D, Schade D, Schneider G, Kumar K, Ziegler S, Waldmann H (2018). Combined proteomic and in silico target identification reveal a role for 5-Lipoxygenase in developmental signaling pathways. Cell Chem Bio
doi: https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2018.05.016

Lee YC, Kumar K, Waldmann H (2017). Ligand-directed Divergent Synthesis of Carbo- and Heterocyclic Ring Systems. Angew Chem Int Ed Engl
doi: 10.1002/anie.201710247.

Kremer L, Schultz-Fademrecht C, Baumann M, Habenberger P, Choidas A, Klebl B, Kordes S, Schöler HJ, Sterneckert J, Ziegler S, Schneider G., Waldmann H (2017). Discovery of a Novel Hedgehog Signaling Pathway Inhibitor by Cell-based Compound Discovery and Target Prediction. Angew Chem Int Ed Engl
doi: 10.1002/anie.201707394.

Robke L, Laraia L, Carnero Corrales MA, Konstantinidis G, Muroi M, Richters A, Winzker M, Engbring T, Tomassi S, Watanabe N, Osada H, Rauh D, Waldmann H, Wu Y, Engel J. (2017). Small-Molecule Inhibition of the UNC119-Cargo Interaction. Angew Chem Int Ed Engl
doi: 10.1002/anie.201703738.

Lee YC, Patil S, Golz C, Strohmann C, Ziegler S, Kumar K, Waldmann H (2017). A ligand-directed divergent catalytic approach to establish structural and functional scaffold diversity. Nat Commun 8:14043
doi: 10.1038/ncomms14043.

Martín-Gago P, Fansa EK, Klein CH, Murarka S, Janning P, Schürmann M, Metz M, Ismail S, Schultz-Fademrecht C, Baumann M, Bastiaens PI, Wittinghofer A, Waldmann H (2017). A PDE6δ-KRas Inhibitor Chemotype with up to Seven H-Bonds and Picomolar Affinity that Prevents Efficient Inhibitor Release by Arl2. Angew Chem Int Ed Engl
doi: 10.1002/anie.201610957.

Xu H, Golz C, Strohmann C, Antonchick AP & Waldmann H (2016). Enantiodivergent Combination of Natural Product Scaffolds Enabled by Catalytic Enantioselective Cycloaddition. Angew Chem Int Ed Engl 55(27):7761-5.
doi: 10.1002/anie.201602084.

Qian Y, Schürmann M, Janning P, Hedberg C & Waldmann H (2016). Activity-Based Proteome Profiling Probes Based on Woodward's Reagent K with Distinct Target Selectivity. Angew Chem Int Ed Engl 55(27):7766-71.
doi: 10.1002/anie.201602666.

Papke B, Murarka S, Vogel HA, Martín-Gago P, Kovacevic M, Truxius DC, Fansa EK, Ismail S, Zimmermann G, Heinelt K, Schultz-Fademrecht C, Al Saabi A, Baumann M, Nussbaumer P, Wittinghofer A, Waldmann H, Bastiaens PI (2016). Identification of pyrazolopyridazinones as PDEδ inhibitors. Nat Commun 7:11360.
doi: 10.1038/ncomms11360.

Ursu A, Illich DJ, Takemoto Y, Porfetye AT, Zhang M, Brockmeyer A, Janning P, Watanabe N, Osada H, Vetter IR, Ziegler S, Schöler HR & Waldmann H (2016). Epiblastin A Induces Reprogramming of Epiblast Stem Cells Into Embryonic Stem Cells by Inhibition of Casein Kinase 1. Cell Chem Biol 23(4):494-507.
doi: 10.1016/j.chembiol.2016.02.015.

Schröder P, Förster T, Kleine S, Becker C, Richters A, Ziegler S, Rauh D, Kumar K & Waldmann H (2015). Neuritogenic militarinone-inspired 4-hydroxypyridones target the stress pathway kinase MAP4K4. Angew Chem Int Ed Engl 54(42):12398-12403.
doi: 10.1002/anie.201501515.

Švenda J, Sheremet M, Kremer L, Maier L, Bauer JO, Strohmann C, Ziegler S, Kumar K & Waldmann H (2015). Biology-oriented synthesis of a withanolide-inspired compound collection reveals novel modulators of hedgehog signaling. Angew Chem Int Ed Engl 54(19):5596-5602.
doi: 10.1002/anie.201409942.

Akbulut Y, Gaunt HJ, Muraki K, Ludlow MJ, Amer MS, Bruns A, Vasudev NS, Radtke L, Willot M, Hahn S, Seitz T, Ziegler S, Christmann M, Beech DJ & Waldmann H (2015). (-)-Englerin A is a potent and selective activator of TRPC4 and TRPC5 calcium channels. Angew Chem Int Ed Engl 54(12):3787-3791.
doi: 10.1002/anie.201411511.

Vidadala SR, Golz C, Strohmann C, Daniliuc CG & Waldmann H (2015). Highly enantioselective intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition: a route to piperidino-pyrrolizidines. Angew Chem Int Ed Engl 54(2):651-655.
doi: 10.1002/anie.201409942.

Eschenbrenner-Lux V, Küchler P, Ziegler S, Kumar K & Waldmann H (2014). An enantioselective inverse-electron-demand imino Diels-Alder reaction. Angew Chem Int Ed Engl 53(8):2134-2137.
doi: 10.1002/anie.201309022.

Spiegel J, Cromm PM, Itzen A, Goody RS, Grossmann TN & Waldmann H (2014). Direct Targeting of Rab-GTPase–Effector Interactions. Angew Chem Int Ed Engl 53(9):2498-2503.
doi: 10.1002/anie.201308568.

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